7 января 2013 года, в праздник Рождества Христова, в храме состоялись две Божественные литургии: ранняя Литургия началась в 2 часа ночи (исповедь началась в 1 час ночи, часы — в 1:35). Поздняя Литургия началась в 9:00 (исповедь — в 8:00, часы — в 8:35).
22 марта 2013 года, в канун дня памяти 40 Севастийских мучеников, утреню с полиелеем в храме преподобных Афанасия и Феодосия Череповецких совершил архиепископ Вологодский и Великоустюгский Максимилиан.
23 марта 2013 года, в день памяти 40 Севастийских мучеников, Литургию в храме преподобных Афанасия и Феодосия Череповецких совершил архиепископ Вологодский и Великоустюгский Максимилиан.
31 марта 2013 года в воскресной школе прихода состоялась благотворительная ярмарка «Поможем вместе», направленная на помощь Татьяне Кузиной и ее трем внукам. На ярмарке были представлены творческие работы, сделанные руками учеников школы.
13 апреля 2013 года была создана группа воскресной школы храма преподобных Афанасия и Феодосия Череповецких — https://vk.com/kaf_sobor. В дальнейшем, после смены руководителя школы, эта группа перестала функционировать и была создана новая группа.
4 мая 2013 года, в Великую Субботу, в храме утром совершалась утреня с чином Погребения, а затем Литургия. Служба началась рано: в 5:00 утра.
4 мая 2013 года в приходе с 12:00 до 18:00 проходило освящение пасхальных снедей.
5 мая 2013 года, в праздник Пасхи, с храме состоялась ночная Литургия.
5 мая 2013 года совершение Пасхальной вечерни в храме преподобных Афанасия и Феодосия Череповецких возглавил архиепископ Вологодский Максимилиан.
25 мая 2013 г. состоялась паломническая поездка воспитанников воскресной школы прихода в город Устюжну.
7 мая 2013 года прошел праздник Пасхи в Воскресной школе. На празднике были представлены сценки, стихи, конкурсы, музыкальные номера. После концерта состоялась благотворительная ярмарка.
С сентября 2013 года в воскресной школе прихода стали проводить занятия по Закону Божию для родителей учеников воскресной школы: в субботу в 11:50 и в воскресенье в 11:00. Кроме того, занятия для взрослых прихожан, по-прежнему проводятся по понедельникам в 18:00.
14 сентября 2013 года начались занятия в приходской воскресной школе. Кроме вероучительных дисциплин в школе можно посетить занятия такие, как: «православная художественная фотография», » русская народная кукла», выжигание, подготовка к школе и др.
14 сентября 2013 года прихожане храма приняли участие в Крестном ходе «О благополучии семейной жизни», состоявшемся по благословению Архиепископа Вологодского и Великоустюгского Максимилиана. Крестоходцы прошли с молитвой 13 километров пути, от села Степановское до деревни Парфеново Череповецкого района с иконой Пресвятой Богородицы «Неопалимая Купина».
11 октября 2013 года храму были переданы в дар 3 иконы: икону Господа Вседержителя (размещена в алтаре на горнем месте), икону Божией Матери «Млекопитательница» от Андрея Григорьевича Гурьева, основателя компании ФосАгро; икону Божией Матери «Казанская» от губернатора Вологодской области О.А. Кувшинникова.
К 4 ноября 2013 года участниками Молодёжного объединения «АиФ» для раздачи череповчанам был разработан Информационный лист «Что празднуем 4 ноября?». Опубликован участником Молодёжного объединения «АиФ» Максимом Мацкевичем в группе объединения Вконтакте: https://vk.com/wall-60729140_13. Руководит Молодёжным объединением клирик прихода диакон Сергий Колпин.
25 ноября 2013 года была создана Вконтакте группа Молодёжного объединения храма преподобных Афанасия и Феодосия Череповецких. Администратором группы являлся чтец и певчий приходского хора Максим Мацкевич.
30 ноября 2013 года состоялась паломническая поездка воспитанников и педагогов воскресной школы прихода в Спасо-Прилуцкий Димитриев монастырь и храмы города Вологды.
К 4 декабря, празднику Введения во храм Пресвятой Богородицы, участниками Молодёжного объединения «АиФ» для раздачи череповчанам был разработан Информационный лист, посвященный празднику. Опубликован участником Молодёжного объединения «АиФ» Максимом Мацкевичем в группе объединения Вконтакте: https://vk.com/wall-60729140_15.
9 декабря 2013 года, в день памяти преподобных Афанасия и Феодосия Череповецких, храм святых Афанасия и Феодосия г.Череповца отметил престольный праздник. Божественную литургию совершил архиепископ Вологодский Максимилиан в сослужении настоятеля храма иерея Андрея Исаева, клириков храма иерея Александра Краева, иерея Павла Массёрова, а также настоятеля Архиерейского подворья Воскресенского собора протоиерея Валерия Белова. После Божественной литургии были совершены молебен и крестный ход вокруг храма.
К 9 декабря 2013 года, дню памяти преподобных Афанасия и Феодосия Череповецких, частниками Молодёжного объединения «АиФ» для раздачи череповчанам был разработан Информационный лист, посвященный святым. Опубликован участником Молодёжного объединения «АиФ» Максимом Мацкевичем в группе объединения Вконтакте: https://vk.com/wall-60729140_17, администратором которой также является Максим Мацкевич, чтец и певчий приходского хора.
К 19 декабря 2013 года, дню памяти святителя Николая Чудотворца, участниками Молодёжного объединения «АиФ» был разработан для раздачи прихожанам Информационный лист, посвященный святому: https://vk.com/wall-60729140_20. Подобные информационные листы создаются объединением к различным церковным праздникам. Руководит Молодёжным объединением клирик прихода диакон Сергий Колпин. Информацию о деятельности объединения в группе Молодёжного объединения «АиФ» Вконтакте (https://vk.com/molkafche) публикует его активный участник, чтец и певчий приходского церковного хора Максим Мацкевич.
Богослужебные особенности.
В связи с нехваткой священнослужителей в приходе Литургия в храме совершалась не каждый день. Так, например, с 21 по 27 января Литургия не совершалась с понедельника по четверг: 21, 22, 23, 24 января. С 28 января по 3 февраля Литургия не совершалась с понедельника по четверг: 28,29,30,31 января. С 7 по 14 октября 2013 года, Литургия не совершалась в понедельник 7 октября и четверг 10 октября. А на неделе с 4 по 10 марта 2013 года Литургия не совершалась 4,5,6,7 марта. В эти дни утром совершались только водосвятный молебен и панихида.
Даже на светлой седмице в 2013 году не было возможности совершать богослужение в храме каждый день. Так, в Светлую седмицу с 6 по 12 мая 2013 года в храме не совершалось никаких служб 8 и 9 мая, в Светлую среду и Светлый четверг.
В летний период службы в храме совершались реже. Так, с 22 по 28 июля 2013 года, 22 июля в понедельник, 25 июля, в четверг, службы в храме не совершались, хотя храм был открыт. Работал в обычном режиме: с 8:00 до 20:00. На этой неделе меньше совершалось и Литургий. Так, Литургия не совершалась в понедельник, вторник, четверг, пятницу, 22, 23, 25, 26 июля.
В дни памяти особо чтимых святых и икон Божией Матери на вечернем богослужении читался акафист. Так, вечером 5 февраля 2013 года, в канун дня памяти блаженной Ксении Петербургской, на утрене с полиелеем читался акафист блаженной Ксении Петербургской. 7 октября 2013 года, на утрене с полиелеем читался акафист преподобному Сергию Радонежскому, в канун дня памяти святого; вечером 24 февраля, в канун дня памяти Иверской иконы Божией Матери, на утрене с полиелеем читался акафист Иверской иконе Пресвятой Богородицы. При этом вечерня вечером не совершалась. Служилась только утреня.
По воскресным дням после вечерни, начинавшейся в 17:00, совершался молебен преподобным Афанасию и Феодосию Череповецким.
Если воскресенье шло после Господского праздника, то в воскресный день после вечерни читался акафист празднику. Так, 20 января, в воскресенье, после праздника Крещения Господня, на вечернем богослужении после вечерни совершался молебен с чтением акафиста Святому Богоявлению.
Исповедь начиналась в 8:00, Часы: в 8:35, Литургия: в 9:00.
После Литургии совершались водосвятный молебен и панихида. Водосвятный молебен совершался каждый день, даже в воскресенье. Вечернее богослужение начиналось в 17:00.
В первую неделю Великого поста утреннее богослужение в будни начиналось в 8:00, вечернее — в 17:00.
Бывали дни, когда богослужения в храме совсем не совершались, например, 9 января, при этом храм был открыт для верующих.